MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes SLCC7179

Total Repeats: 65703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018593	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018593	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018593	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018593	G	7	7	306	312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018593	CAAT	2	8	321	328	50 %	25 %	0 %	25 %	404412107
6	NC_018593	A	8	8	363	370	100 %	0 %	0 %	0 %	404412107
7	NC_018593	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404412107
8	NC_018593	TAT	2	6	440	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404412107
9	NC_018593	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404412107
10	NC_018593	GAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404412107
11	NC_018593	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404412107
12	NC_018593	GGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404412107
13	NC_018593	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404412107
14	NC_018593	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404412107
15	NC_018593	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404412107
16	NC_018593	CTTA	2	8	944	951	25 %	50 %	0 %	25 %	404412107
17	NC_018593	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412107
18	NC_018593	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404412107
19	NC_018593	AC	3	6	1015	1020	50 %	0 %	0 %	50 %	404412107
20	NC_018593	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412107
21	NC_018593	ATT	3	9	1041	1049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404412107
22	NC_018593	GACC	2	8	1056	1063	25 %	0 %	25 %	50 %	404412107
23	NC_018593	CCA	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404412107
24	NC_018593	A	6	6	1173	1178	100 %	0 %	0 %	0 %	404412107
25	NC_018593	AGT	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412107
26	NC_018593	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404412107
27	NC_018593	TAA	2	6	1301	1306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404412107
28	NC_018593	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404412107
29	NC_018593	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404412107
30	NC_018593	AAG	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404412107
31	NC_018593	CGTT	2	8	1418	1425	0 %	50 %	25 %	25 %	404412107
32	NC_018593	AGA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404412107
33	NC_018593	A	7	7	1442	1448	100 %	0 %	0 %	0 %	404412107
34	NC_018593	TC	3	6	1490	1495	0 %	50 %	0 %	50 %	404412107
35	NC_018593	AG	3	6	1497	1502	50 %	0 %	50 %	0 %	404412107
36	NC_018593	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412107
37	NC_018593	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404412107
38	NC_018593	ACA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404412107
39	NC_018593	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	404412107
40	NC_018593	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404412107
41	NC_018593	A	7	7	1639	1645	100 %	0 %	0 %	0 %	404412107
42	NC_018593	GCA	2	6	1744	1749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018593	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018593	T	6	6	1804	1809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018593	ATTA	3	12	1810	1821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018593	A	7	7	1848	1854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018593	AAC	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404412108
48	NC_018593	ATG	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412108
49	NC_018593	AG	3	6	2073	2078	50 %	0 %	50 %	0 %	404412108
50	NC_018593	TGG	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404412108
51	NC_018593	TCAA	2	8	2097	2104	50 %	25 %	0 %	25 %	404412108
52	NC_018593	CGT	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404412108
53	NC_018593	AGA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404412108
54	NC_018593	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	404412108
55	NC_018593	CCT	2	6	2198	2203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404412108
56	NC_018593	A	6	6	2292	2297	100 %	0 %	0 %	0 %	404412108
57	NC_018593	TACT	2	8	2348	2355	25 %	50 %	0 %	25 %	404412108
58	NC_018593	TGA	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412108
59	NC_018593	TAAA	2	8	2498	2505	75 %	25 %	0 %	0 %	404412108
60	NC_018593	GAT	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412108
61	NC_018593	CAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404412108
62	NC_018593	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	404412108
63	NC_018593	TAT	2	6	2579	2584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404412108
64	NC_018593	TAA	2	6	2724	2729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404412108
65	NC_018593	TTA	2	6	2732	2737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404412108
66	NC_018593	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404412108
67	NC_018593	ATG	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412108
68	NC_018593	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412108
69	NC_018593	A	6	6	3019	3024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018593	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018593	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412109
72	NC_018593	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404412109
73	NC_018593	T	7	7	3161	3167	0 %	100 %	0 %	0 %	404412109
74	NC_018593	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412109
75	NC_018593	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404412109
76	NC_018593	GCT	2	6	3265	3270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404412109
77	NC_018593	T	7	7	3294	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	404412109
78	NC_018593	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404412109
79	NC_018593	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404412109
80	NC_018593	T	6	6	3419	3424	0 %	100 %	0 %	0 %	404412109
81	NC_018593	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404412109
82	NC_018593	CTT	2	6	3469	3474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404412109
83	NC_018593	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412109
84	NC_018593	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404412109
85	NC_018593	ACC	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404412109
86	NC_018593	T	7	7	3617	3623	0 %	100 %	0 %	0 %	404412109
87	NC_018593	TGA	2	6	3638	3643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412109
88	NC_018593	T	6	6	3657	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	404412109
89	NC_018593	TGT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404412109
90	NC_018593	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404412109
91	NC_018593	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404412109
92	NC_018593	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404412109
93	NC_018593	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404412109
94	NC_018593	TCC	2	6	3997	4002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404412109
95	NC_018593	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404412109
96	NC_018593	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404412109
97	NC_018593	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	404412109
98	NC_018593	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404412109
99	NC_018593	TTTGT	2	10	4327	4336	0 %	80 %	20 %	0 %	404412109
100	NC_018593	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404412109
101	NC_018593	A	7	7	4436	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	404412109
102	NC_018593	CGA	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404412109
103	NC_018593	A	7	7	4475	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018593	T	7	7	4504	4510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018593	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018593	C	6	6	4524	4529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_018593	A	7	7	4542	4548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018593	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018593	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018593	A	7	7	4620	4626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018593	TGAT	2	8	4702	4709	25 %	50 %	25 %	0 %	404412110
112	NC_018593	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404412110
113	NC_018593	AACC	2	8	4976	4983	50 %	0 %	0 %	50 %	404412111
114	NC_018593	TGCT	2	8	5002	5009	0 %	50 %	25 %	25 %	404412111
115	NC_018593	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404412111
116	NC_018593	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404412111
117	NC_018593	ATTT	2	8	5301	5308	25 %	75 %	0 %	0 %	404412111
118	NC_018593	TTCA	2	8	5463	5470	25 %	50 %	0 %	25 %	404412111
119	NC_018593	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404412111
120	NC_018593	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404412111
121	NC_018593	A	6	6	5602	5607	100 %	0 %	0 %	0 %	404412111
122	NC_018593	AATC	2	8	5611	5618	50 %	25 %	0 %	25 %	404412111
123	NC_018593	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404412111
124	NC_018593	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412111
125	NC_018593	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404412111
126	NC_018593	CTT	2	6	5802	5807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404412111
127	NC_018593	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412111
128	NC_018593	CGA	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404412111
129	NC_018593	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404412111
130	NC_018593	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404412111
131	NC_018593	A	7	7	5969	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	404412111
132	NC_018593	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018593	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018593	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018593	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404412112
136	NC_018593	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404412112
137	NC_018593	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412112
138	NC_018593	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	404412112
139	NC_018593	A	6	6	6310	6315	100 %	0 %	0 %	0 %	404412112
140	NC_018593	GTC	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404412112
141	NC_018593	TGG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404412112
142	NC_018593	GGC	3	9	6372	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404412112
143	NC_018593	GTG	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404412112
144	NC_018593	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412112
145	NC_018593	GAA	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404412112
146	NC_018593	AAC	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404412112
147	NC_018593	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	404412112
148	NC_018593	GAA	2	6	6687	6692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404412112
149	NC_018593	TAAA	2	8	6751	6758	75 %	25 %	0 %	0 %	404412112
150	NC_018593	CCA	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404412112
151	NC_018593	ATTT	2	8	6786	6793	25 %	75 %	0 %	0 %	404412112
152	NC_018593	GAT	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412112
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154	NC_018593	CAT	2	6	6860	6865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404412112
155	NC_018593	TTA	2	6	6940	6945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404412112
156	NC_018593	CG	3	6	6953	6958	0 %	0 %	50 %	50 %	404412112
157	NC_018593	TAA	2	6	6962	6967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404412112
158	NC_018593	TGA	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412112
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161	NC_018593	TAAA	2	8	7135	7142	75 %	25 %	0 %	0 %	404412112
162	NC_018593	ATG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412112
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169	NC_018593	TGG	2	6	7499	7504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404412112
170	NC_018593	ATTA	2	8	7538	7545	50 %	50 %	0 %	0 %	404412112
171	NC_018593	ACT	2	6	7586	7591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404412112
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174	NC_018593	AAC	2	6	7798	7803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404412112
175	NC_018593	ACA	2	6	7812	7817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404412112
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179	NC_018593	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_018593	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_018593	TAAA	2	8	8105	8112	75 %	25 %	0 %	0 %	404412113
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242	NC_018593	A	6	6	10656	10661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_018593	A	6	6	10706	10711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_018593	A	6	6	10723	10728	100 %	0 %	0 %	0 %	404412114
245	NC_018593	AGT	2	6	10760	10765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412114
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250	NC_018593	ACT	2	6	10865	10870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404412114
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253	NC_018593	ATTA	2	8	11021	11028	50 %	50 %	0 %	0 %	404412114
254	NC_018593	ACA	2	6	11050	11055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404412114
255	NC_018593	CACATT	2	12	11199	11210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404412114
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259	NC_018593	AC	3	6	11538	11543	50 %	0 %	0 %	50 %	404412114
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264	NC_018593	TTGAT	2	10	11755	11764	20 %	60 %	20 %	0 %	404412114
265	NC_018593	TGA	2	6	11813	11818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404412114
266	NC_018593	GTG	2	6	11854	11859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404412114
267	NC_018593	TTA	2	6	11872	11877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404412114
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269	NC_018593	CAT	2	6	12111	12116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404412114
270	NC_018593	A	6	6	12132	12137	100 %	0 %	0 %	0 %	404412114
271	NC_018593	ATT	2	6	12188	12193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404412114
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401	NC_018593	TGT	2	6	18495	18500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404412120
402	NC_018593	TGG	2	6	18501	18506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404412120
403	NC_018593	CTT	2	6	18564	18569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404412120
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440	NC_018593	GCA	2	6	20179	20184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404412122
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443	NC_018593	TAATT	2	10	20369	20378	40 %	60 %	0 %	0 %	404412123
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472	NC_018593	A	7	7	21562	21568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_018593	CA	3	6	22561	22566	50 %	0 %	0 %	50 %	404412124
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